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会员2877821185发布的供求信息

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百泰派克将得到的差异代谢物使用MBRole进行代谢通路富集,使用KEGG数据库做为背景,进行相关通路分析。选取同物种的所有代谢物作为背景,分析 P value < 0.05的代谢通路。我们可提供的两种代谢通路图,富集的代谢通路以及相关T检验分析结果会以表格的形式给出。

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-11 09:56:05

为了评价候选代谢物的合理性,同时更全面直观地显示样本之间的关系以及代谢物在不同样本中的表达模式差异,我们利用定性的显著性差异代谢物的表达量对各组样本进行层次聚类(Hierarchical Clustering),从而辅助我们准确地筛选标志代谢物,并对相关代谢过程的改变进行研究。一般来说,当筛选的候选代谢物合理且准确时,同组样本能够通过聚类出现在同一簇( Cluster)中。同时,聚在同一簇内的代谢物具有相似的表达模式,可能在代谢过程中处于较为接近的反应步骤中。

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-10 09:46:17

在进行两组样本间的差异代谢物分析时,常用的单变量分析方法包括变异倍数分析( Fold Change Analysis, FC Analysis)、T 检验,以及综合前两种分析方法的火山图( Volcano Plot)。利用单变量分析可以直观地显示两样本间代谢物变化的显著性,从而帮助我们筛选潜在的标志代谢物(通常以 FC > 2.0 且 P value < 0.05 作为筛选标准)。 百泰派克选择有多维统计分析筛选标准( VIP>1)和单变量统计分析 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-10 09:44:50

数据的完整性和准确性是后续获得具有统计学和生物学意义的分析结果的必要 条件。在确保实验设计的合理性和实验数据的准确性的基础上,百泰派克首先对数据的完整性进行检查,对缺失值进行删除或者补充,删除极值,并对数据进行样本间和代谢物间的归一化处理,以确保各样本之间和代谢物之间可平行比较。原始数据中,缺失值超过 50%的代谢物将被去除,不参与后续分析;对代谢物的表达量进行对数转换并利用 Autoscaling 方法( Mean-centered and divided by the standard de ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-09 14:16:47

不同于主成分分析( PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis,(PLS-DA)或 Orthogonal PLS-DA,(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两分组比较的PLS-DA模型或OPLS-DA模型,模型得到的参数评价会以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分别表示所建模型对X和Y矩阵的解释率,Q2标示模型的预测能力,理 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-09 14:15:29

主成分分析( Principal Component Analysis, PCA) 是将原本鉴定到的所有代谢物重新线性组合,形成一组新的综合变量,同时根据所分析的问题从中选取2-3个综合变量,使它们尽可能多地反映原有变量的信息,从而达到降维的目的。同时,对代谢物进行主成分分析还能从总体上反应组间和组内的变异度。总体样本 PCA 分析采用 PCA 的方法观察所有各组样本之间的总体分布趋势,找出可能存在的离散样本,综合考虑各种因素(样品数,样品珍贵程度,离散程度)决定离散点的除去与否。 百泰派 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-08 10:19:13

百泰派克采用 QC 样本谱图比对和主成分分析两种方法,项目实验中的 QC 样本数据进行分析评价。将分析得到的 QC 样本 UPLC-QTOF-MS 总离子流图,进行谱图重叠比较,见下图。结果表明各色谱峰的响应强度和保留时间基本重叠,说明在整个实验过程中仪器误差引起的变异较小。

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-08 10:02:07

脂质是自然界中存在的一大类极易溶解于有机溶剂、在化学成分及结构上非均一的化合物,主要包括脂肪酸及其天然发生的衍生物(如酯或胺),以及与其生物合成和功能相关的化合物。脂质的重要生物功能及其与疾病的关系,加上基因组学、蛋白质组学和代谢组学的发展催生了脂质组学 (Lipidomics)这一新的研究领域。脂质组学是对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定,了解脂质的结构和功能,进而揭示脂质代谢与细胞、器官乃至机体的生理、病理过程之间的关系的一门学科。由于脂质分子结构的多 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-05 09:35:32

尿液中化学种类极多,包括微生物代谢产物和哺乳动物代谢产物。药物,污染物和工业化学品也可能在尿液中存在,由于尿液不具有稳恒调节作用,作为废弃物,可以反映代谢紊乱,可提供对生理挑战或疾病进程的应答的广泛系统改变。 在代谢物谱研究中,尿液是一种关键的生物基质,因为它的收集是非侵袭性的(因此较容易),虽然它依赖于动物和收集时间,但尿液样本几乎对体积没有限制。而且,尿液易于经一系列的操作得到样品,允许用于研究的暂时临时的代谢改变。尿液中的化合物比其它基质更多,使得尿液代谢组的数据分析和生物学解释更具 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-05 09:31:28

人体血液作为代谢组学研究领域中的重要体液样本,主要分为血浆和血清。与血浆相比,血清不含纤维蛋白原,成分较为简单,约含有1000多种内源性小分子代谢物,是重要的代谢组学体液样本。由于血清中所含小分子代谢物种类多、极性跨度大,既有高极性的氨基酸、葡萄糖和核苷类等,也有低极性的脂类和固醇类等,代谢物成分的复杂性增加了血清样品分析的难度。因此与血浆相似,血清的前处理过程相对复杂。 百泰派克采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600两类质谱仪建立了针对于血清代谢组学研 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-04 10:04:41

微生物在地球上已经存在了至少38亿年,几乎遍及生物圈的各个角落,微生物代谢能力和代谢形式的多样性是地球上的其他生物无法比拟的。微生物基因组较小,基因组学、转录组学和蛋白组学得到的数据相比真核生物来说相对较少,代谢组的研究则不会受此影响(已阐明的的微生物代谢物大概有20000种),可以全面理解微生物生理功能;这些因素使得代谢组学在微生物研究中具有自己独特的优势。代谢组学作为功能基因组学研究技术家族的新成员,借助微生物细胞代谢物全组分分析用以反应细胞对环境和基因变化的反应;由于代谢组学更接近于细胞功 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-04 10:03:45

植物代谢组是代谢组学的一个重要分支,定义为以植物为研究对象的代谢组学;研究不同物种,不同基因类型或不同生态类型的植物在不同生长时期或受某种刺激前后的所有小分子代谢产物,对其进行定性定量分析,并找出代谢变化的规律。为了在不断变化和恶劣环境下生存,植物进化出了复杂的,多细胞结构的不同功能器官;这些器官包含了多种细胞类型,这些不同类型的细胞又转移的代谢机制来精确实现它们特定的功能。环境,温度和季节的影响通过代谢变化得到补偿;由于非生物和生物的胁迫影响,植物派生出一个复杂的代谢化合物库。既有维持植物生命 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-03 10:09:19

BTP-色氨酸代谢相关物质分析 动物体色氨酸代谢的色氨酸有两个来源:一个是组织蛋白质分解的内源氨基酸,约占2/3;另外一个是从日粮中消化吸收的外源性氨基酸,约占1/3。色氨酸代谢途径也有两个:一个是合成组织蛋白质,另一个则是分解代谢。色氨酸的吸收半周期为 1.73 h,清除半周期为0.73~0.74h,其生物利用率为76 %。色氨酸在代谢过程中与碳水化合物、蛋白质、脂肪、维生素和微量元素等各种营养素之间有十分密切的关系。色氨酸是营养必需的氨基酸,来自饮食中蛋白质供应.除了自身能够组成体内蛋白 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-02 09:41:07

BTP-氨基酸/尿素循环代谢相关物质分析 蛋白质水解生成的氨基酸在体内的代谢包括两个方面:一方面主要用以合成机体自身所特有的蛋白质、多肽及其他含氮物质;另一方面可通过脱氨作用,转氨作用,联合脱氨或脱羧作用,分解成α-酮酸、胺类及二氧化碳。氨基酸分解所生成的α-酮酸可以转变成糖、脂类或再合成某些非必需氨基酸,也可以经过三羧酸循环氧化成二氧化碳和水,并放出能量。尿素循环(urea cycle):又称为鸟氨酸循环,肝脏中2分子氨(1分子氨是游离的,1分子氨来自天冬氨酸)和1分子CO2生成1分子尿素 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-02 09:40:02

BTP-碳代谢相关物质分析 百泰派克研发的炭代谢分析主要包括一碳代谢(One carbon metabolism)和中心碳代谢(Central carbon metabolism)相关物质分析。某些氨基酸在代谢过程中能生成含一个碳原子的基团,经过转移参与生物合成过程。这些含一个碳原子的基团称为一碳基团(one carbon unit)或一碳单位(C1 unit或one carbon unit)。有关一碳单位生成和转移的代谢称为一碳代谢。中心碳代谢在代谢网络中扮演着极为重要的角色,它是碳元素从 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-01 15:24:03

BTP-生物标志物分析 生物标志物(Biomarker),是通过测定生物体液,细胞和组织的各种反应,用生物化学、免疫学、遗传学等方法,来指示污染物的存在与否及生物个体的反应。生物标志物能够直接以生物体内靶细胞或靶分子为反应终点,十分敏感。检测结果能够说明生物个体内的细胞和组织是否已经暴露于超量的污染物中,环境污染物是否已对生物靶标诱发了毒性效应,以及毒性效应是否对种群,群落或生态系统引起了连锁反应。百泰派克公司建立了以ACQUITY UPLC/TripleQuad5500(Waters/AB ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-07-01 15:22:59

BTP-类胡萝卜素类物质分析 类胡萝卜素(Carotenoid)是一类有机色素,被发现存在于植物的叶绿体或者有色体、一些行光合作用的藻类,某些类型的细菌和真菌含有类胡萝卜素。胡萝卜素属于四萜烯有机分子色素。动物不能制造类胡萝卜素(虽然已知一种蚜虫获得了合成胡萝卜素——红酵母烯(torulene)的能力,因为该蚜虫体内具有产生“红酵母烯去饱和酶”的基因,源自真菌的基因水平转移)。动物通过不同的新陈代谢途径,从其摄食中获得类胡萝卜素。百泰派克公司建立了以ACQUITY UPLC/TripleQu ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-06-28 10:01:42

BTP-硫醇类物质分析 硫醇是包含巯基官能团(-SH)的一类非芳香化合物。是一类有机硫化合物。可以看成醇中的氧被硫替换。硫醇的酸性比相应的醇强,可溶于氢氧化钠的乙醇溶液中生成比较稳定的盐,通入二氧化碳又变回硫醇。硫醇可与一些重金属盐生成不溶于水的硫醇盐,两者软软相吸。许多重金属离子在体内的毒性即是因为其可与生物分子的巯基结合。另一方面,也可利用硫醇(如二巯基丙酸)通过形成不溶沉淀的方法将重金属离子从尿液排出,起到解毒作用。百泰派克公司建立了以ACQUITY UPLC/TripleQuad55 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-06-28 10:00:35

BTP-核苷酸及相关物质分析 核苷酸(Nucleotide)为核酸的基本组成单位。核苷酸由一个含氮碱基作为核心,加上一个五碳糖和一个磷酸基团组成。含氮碱基有五种可能,分别是腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。五碳糖为脱氧核糖者称为脱氧核糖核苷酸(Deoxynucleotides),五碳糖为核糖者称为核糖核苷酸(RNA的单体)。环状核苷酸(Cyclic nucleotide,cNMP)是在糖和磷酸酯基团之间具有环状键排列的单磷酸核苷酸。百泰派克公司采用以GC/MS(7890A/5975C ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-06-27 09:59:29

BTP-醛类及相关物质分析 醛(英语:aldehyde)是一种含有甲酰基的一类有机化合物。这种官能团具有结构通式:R-CHO,其中的羰基中心连接了一个氢原子与一个R基团。不带有R的基团称为醛基或甲酰基。醛与酮化合物的区别在于羰基所处的位置是在碳链骨架的末端或是在两个碳原子之间。醛在有机化学中很常见,许多的香水都属醛类。百泰派克公司以ACQUITY UPLC/TripleQuad5500(Waters/AB Sciex)平台为主,能够对>13种醛类及相关物质进行定量及定性分析,其 ...

类型: 供应 类别: 科学技术 生物技术 地区: 北京 北京 用户: 2877821185 日期: 2019-06-26 14:03:52

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